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2025-01-14 139 化工行业报告
合成生物学涵盖的代谢反应极为丰富。目前代谢数据库涵盖 14971个反应和14842个代谢物的代谢途径。 根据《生物化学地图集》预测,137416个代谢反应将发生在 生物化学空间中,大约9.2%的代谢反应已通过实验进行了描 述,而剩余的90.8%的反应有待表征。 在一个细胞里面可以有几千个反应发生,典型的在大肠杆菌 里面有2000多个已知的反应,合成生物学对这些反应进行增 添、改造甚至是引入一些自然界不存在的新反应,可以极大 的改变底盘细胞物质转化的能力,可以让它定向地转化,理 论上99.5%以上的有机化合物都可以通过生物合成的方法来 实现。基因编辑:按照代际可分为4类,即锌指核酸酶(ZFN)技术、类转录激活因子核酸酶(TALEN)技术、成簇规律间隔短回文重 复(CRISPR)技术以及多重自动基因组改造(MAGE)/ 接合组装基因组改造(CAGE),其中CRISPR/Cas9技术的出现革新 了基因编辑的方法,相较以前技术具有操作难度小、编辑成本低、打靶效率高、无痕编辑等优点,在合成生物学领域被广泛应用 和研究,并由此开发和设计出了大量新的基因编辑元件、工具和基因线路。案例:CRISPR技术在酶工程中的应用: 1)色氨酸:CRISPR引导的DNA聚合酶可用于靶 向核苷酸进行诱变,提供极高的靶向突变率并引入 一系列可能有益于酶功能的新突变,通过对于这种 氨基酸合成的新酶的工程化,实现了色氨酸产量近 40%的增加。 2)游离脂肪酸:CRISPR/Cas9被用来删除酵母中 脂肪酸生产途径中的8个基因,并最终使得游离脂 肪酸产量在几天内增加了30倍。
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